MARTECs bestyrelse består af syv medlemmer:

Kim Sørensen - Formand, Aalborg Universitet
Morten Vestergaard - Næstformand, Vestergaard Marine Service
Birgit Hansen - Medlem, Frederikshavn Kommune
Carl Jesper Hermansen - Medlem 
Jens Ditlev Lauritzen - Medlem, Lauritzen Fonden
Lars-Ole Gundestrup - Medarbejderrepræsentant, MARTEC
Martin Højer Bacci - Studenterrepræsentant